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GST标签的去除
GST标签的去除可在目的蛋白的功能或结构研究之前进行。根据目的蛋白的性质不同，完全消化所需的蛋白酶量、温度、及孵育长度也各异。
含有PreScission蛋白酶、凝血酶或Xa因子识别位点的标签蛋白可在与Glutathione Sepharose层析填料结合时切割，或者洗脱后在溶液中切割。当GST蛋白与柱结合时，切割释放了目的蛋白，它与结合缓冲液一起洗脱，而GST部分仍与填料结合。一般来说，柱上切割是推荐使用的方法，因为许多潜在的杂质都能洗掉，目的蛋白在洗脱时具有更高的纯度。如果需要优化切割条件，建议洗脱后切割。
从蛋白或肽段制备中去除丝氨酸蛋白酶如凝血酶、Xa因子和PreScission蛋白酶，可利用Benzamidine Sepharose 4 Fast Flow来进行，此填料有大包装。为了方便，Benzamidine Sepharose 4 Fast Flow也有预填充的HiTrap Benzamidine FF 1 ml和 5 ml柱。
凝血酶
凝血酶能够对带有可接近的凝血酶识别序列的融合蛋白进行位点特异的切割，用于消化包含凝血酶识别序列的pGEX载体所制备的GST标签蛋白（pGEX-1λT、pGEX-2T、pGEX-2TK、pGEX-4T-1、pGEX-4T-2及pGEX-4T-3）。在22°C，1×PBS中，一个单位的酶16小时可切割100 μg待测GST标签蛋白，切割效率在90%以上。
Xa因子
纯化自牛血浆的Xa因子特异切割四肽Ile-Glu-Gly-Arg之后的蛋白，可用于消化包含此序列的pGEX载体所制备的GST标签蛋白（pGEX-3X、pGEX-5X-1、pGEX-5X-2和pGEX-5X-3）。在22°C，1 mM CaCl2、100 mM NaCl和50 mM Tris-HCl（pH 8.0）的反应体系中，一个单位的酶16小时可切割100 μg待测GST标签蛋白，切割效率在90%以上。
PreScission蛋白酶
PreScission蛋白酶是一种遗传改造的融合蛋白，由人鼻病毒3C蛋白酶和GST组成。这种蛋白
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