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高斯(Gaussian)相关的免费软件 2nd version [2010-09-25]

主要介绍了高斯软件相关的图形分析界面软件,用于结果的后期分析。

献给初学高斯并挣扎的同志们…(经常总结确实能学到很多东西)

Gaussian相关的免费软件(Gaussview除外) 图形分析界面

(本文为免费文档,请勿将此文件强加任何收费限制

高斯(Gaussian)相关的免费软件 2nd version [2010-09-25]

!!!! )

(Second edited by 废man 2010-09-25 12:39 )

欢迎大家继续补充,请在上面的括号内加上自己的名字并注明修改日期,并将补充的文字用

红色字体标明,谢谢!

除了Gaussian使用的软件外, doc.guandang.net 提到了众多的分子模拟软件,欢迎大家去看看。

1. Molden (免费)电子密度

是由荷兰的G. Schaftenaar于1991年开发的从头算Gamess,Gaussian和半经验Mopac/Ampac接口的电子密度显示软件,通常运行于Unix环境下,Windows下需要安装X-WinPro来支持其运行。Molden可以显示分子轨道、电子密度等值线图或3D格点图等,同时可以输出postscript、XWindows、VRML、Povray、OpenGL、tekronix4014、hpgl和hp2392格式的文件,Molden可以读取chemx、PDB、mopac/ampac以及其它一些格式的文件。Molden有方便的Z矩阵编辑器,可以方便的对构建的分子进行操作。对于高斯而言,与Molden结合使用的时候需要使用IOP(6/7=3)关键字。

草氨酸钠静电势的例子参考doc.guandang.net

2.

高斯(Gaussian)相关的免费软件 2nd version [2010-09-25]

Molekel (免费)

分子模型和电子结构显示的免费工具,支持的分子结构计算程序输出文件格式有:GAUSSIAN、GAMESS-US、ADF、ZINDO、MOS、HONDO, Jaguar, MOLPRO, HyperChem, Mopac, NWChem和QChem等和NBO等。支持Z-matrix格式、Chem3D直角坐标、CACAO直角坐标和XYZ等多种格式的文件。Molekel通过读取相关的结果文件,可以制作分子的电子密度图、分子轨道图和静电势图等,为了显示高斯的结果,通常需要在输入文件中加入关键字“#P GFPRINT, POP=FULL, iop(6/7=3)”。支持分子轨道,电子密度,静电势等三维以及二维的切片和光谱显示等,具体操作可以参考网页的flash教程。

此外,(Molkel)Molekel还支持高斯的NBO结果,具体方法参考紫霞或厦大论坛Elizerbeth老鸟的教程:doc.guandang.net

用Molekel画轨道图形doc.guandang.net

3.

高斯(Gaussian)相关的免费软件 2nd version [2010-09-25]

GaussSum (免费)

支持ADF,GAMESS(US),GAMESS-UK,Gaussian,和PC-GAMESS的结果,包括

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